Очень важна последующая обработка колодца. Для начала, через неделю после завершения всех работ необходимо прокачать колодец один, а лучше два раза. Владельцу нового колодца следует помнить и о мерах безопасности: регулярно проводить санобработку. Делается она следующим образом: готовится раствор (ведро воды плюс чайная ложка марганца), выливается в полный колодец, оставляется на полчаса. Затем воду можно скачивать.
Колодец важно правильно эксплуатировать. Во избежание попадания мусора его нужно всегда держать закрытым. Воду берут одним специальным ведром, прикрепленным к тросу или цепочке, ставят его или на столешницу «домика» или на специальную скамеечку, но никак не на землю. Как минимум раз в три года колодцы нужно осматривать и при необходимости очищать от посторонних предметов и мусора.
Особое внимание при эксплуатации колодцев, построенных на плывунах. Частое скачивание большого количества воды за один раз приводит к обмелению, затягиванию таких колодцев песком и возможному сдвигу нижних колец. Потребность в их чистке возникает очень часто.